もう仕方ないので、工場出荷状態に戻そうと思い、unrootから始めましたら、その段階で回復しました。履歴データと本棚書き込みがされるようになりました。特定のプロセスの特定の命令だけストップされる樣に見えるのが？ですが、知らないところで色々起こってるのかもと思い直しました。